Między innymi dlatego zabytkowe centrum zostało w 1981 roku uznane za Miejski Rezerwat Zabytków. Na znaczenie tego miasta na przestrzeni wieków kluczowy wpływ miał jeden z najważniejszych dawnych szlaków regionu – Złoty Szlak, łączący Czechy z Bawarią i przecinający puszczę szumawską. Zwłaszcza w okresie średniowiecza odgrywał on ważną rolę w związku z handlem bawarską solą, transportowaną na grzbietach zwierząt jucznych z biskupiej Pasawy do Prachatic.
A jak to się stało, że Prachaticom udało się zachować swój zabytkowy charakter? Między innymi dzięki stagnacji życia gospodarczego w XVII i XVIII wieku. Dziś miasto oferuje turystom i swoim mieszańców wyjątkową renesansową atmosferę, tylko miejscami przesłoniętą nowszymi empirowymi przeróbkami.
Warte uwagi są również okoliczne tereny wokół miasta – pogórze z najwyższym wzgórzem Libína (1096 m), które płynnie przechodzi w pasmo górskie Szumavy. Wyższa wysokość nad poziomem morza w połączeniu z silnie zróżnicowaną powierzchnią wyraźnie wpływa na lokalne warunki klimatyczne. Średnia temperatura w zimie wynosi tutaj od -5 do -9 °C, średnia temperatura w lecie waha się od 13 do 17°C.